Docker를 실행하고 로그인을 할 때 오류가 발생했다. 이때는 기존의 계정이 존재해서, 오류가 발생했는지 몰랐다. 이때는 자신이 사용하는 브라우저를 바꿔서, docker hub로 들어가 로그인을 다시 해보면 된다. 제대로 login 되었는지 확인하기 위해 아래와 같은 코드를 쳐보자. docker logoutdocker login

1. BWA2 ( reference seq에 mapping)curl -L https://github.com/bwa-mem2/bwa-mem2/releases/download/v2.0pre2/bwa-mem2-2.0pre2_x64-linux.tar.bz2 | tar jxf -cd bwa-mem2-2.0pre2_x64-linux./bwa-mem2위 코드를 차례대로 실행시키면 된다.  2. GATK4 (variant calling)wget https://github.com/broadinstitute/gatk/releases/download/4.2.0.0/gatk-4.2.0.0.zipunzip gatk-4.2.0.0.zip위 코드를 실행시켜 설치를 진행한다. 이후, 설치가 제대로 되었는지 확인하기 위해서 아래 코..

1. Lactiplantibacillus plantarum에서 발현되는 ferritin  데이터 생성. ncbi protein 사이트에 접속해서 "Ferritin Lactiplantibacillus plantarum" 입력했다. 총 43개의 searching result가 나왔고, 이 파일들을 다 모아서 ferritinL.plantarum.raw.fasta 파일을 만들었다. >ALO75854.1 ferritin (plasmid) [Lactiplantibacillus plantarum]MKYTKTKAVLNQLVADLSQMSMIIHQTHWYMRGPNFLKLHPLMDEFMEEIDSQLDVISERLIALDGSPYSTLKEMAENTKIQDWPGEWDKTTPERLAHLVDGYRYLEDLYQHGIEVSDVEKDFST..

1. 사이트 : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/XBR17120.1?report=fasta envelope protein [Severe acute respiratory syndrome-related coronaviru - Protein - NCBIno features Feature First Previous Next Last Detailswww.ncbi.nlm.nih.gov2. linux 환경으로 파일을 전송하기 wget "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=protein&id=XBR17120.1&rettype=fasta&retmode=text" -O coronaEnv.raw.fasta efectc..

1. ubuntu에 anaconda 설치하기 https://www.anaconda.com/download/success Download Now | AnacondaAnaconda is the birthplace of Python data science. We are a movement of data scientists, data-driven enterprises, and open source communities.www.anaconda.com위 홈페이지에 들어가 , 자신의 os에 맞는 버전을 우클릭 후 링크 주소 복사한다. 이후, 아래 코드를 실행한다. wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2024.10-1-Linux-x86_64.sh 2. 다운로드하여진 ..

1. 글씨 키우기  ctrl + shift + +/= 2. 글씨 축소하기  ctrl + - 3. 폰트는 terminal에서 preferences로 들어가 바꾸기 ( 형광색 이용하면 잘 보임) 4. 공유폴더 설정  local pc의 data를 가상환경에 설치되어 있는 ubuntu와 공유하기 위해서는 공유폴더를 설정하는 것이 좋은 대안이다. 따라서 , 공유폴더를 설정해 보자. 저기서 플러스 버튼을 눌러서 , 자동 마운트와 항상 사용을 클릭한 뒤, 공유폴더가 마운트 되길 원하는 경로와 공유폴더가 현재 위치해 있는 경로를 입력해 주면 된다. 이후, 공유폴더에 접속하려 할 때 permission denied 가 뜬다면 다음과 같은 코드를 입력해 보자. 나의 경우, ls -ld share를 실행했을 때 root v..