1. 사이트 : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/XBR17120.1?report=fasta envelope protein [Severe acute respiratory syndrome-related coronaviru - Protein - NCBIno features Feature First Previous Next Last Detailswww.ncbi.nlm.nih.gov2. linux 환경으로 파일을 전송하기 wget "https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/efetch.fcgi?db=protein&id=XBR17120.1&rettype=fasta&retmode=text" -O coronaEnv.raw.fasta efectc..

1. ubuntu에 anaconda 설치하기 https://www.anaconda.com/download/success Download Now | AnacondaAnaconda is the birthplace of Python data science. We are a movement of data scientists, data-driven enterprises, and open source communities.www.anaconda.com위 홈페이지에 들어가 , 자신의 os에 맞는 버전을 우클릭 후 링크 주소 복사한다. 이후, 아래 코드를 실행한다. wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2024.10-1-Linux-x86_64.sh 2. 다운로드하여진 ..

1. 글씨 키우기  ctrl + shift + +/= 2. 글씨 축소하기  ctrl + - 3. 폰트는 terminal에서 preferences로 들어가 바꾸기 ( 형광색 이용하면 잘 보임) 4. 공유폴더 설정  local pc의 data를 가상환경에 설치되어 있는 ubuntu와 공유하기 위해서는 공유폴더를 설정하는 것이 좋은 대안이다. 따라서 , 공유폴더를 설정해 보자. 저기서 플러스 버튼을 눌러서 , 자동 마운트와 항상 사용을 클릭한 뒤, 공유폴더가 마운트 되길 원하는 경로와 공유폴더가 현재 위치해 있는 경로를 입력해 주면 된다. 이후, 공유폴더에 접속하려 할 때 permission denied 가 뜬다면 다음과 같은 코드를 입력해 보자. 나의 경우, ls -ld share를 실행했을 때 root v..

1. 관리자 페이지에 들어가 클립보드 설정 조작 클립보드 공유와 드래그 앤 드롭 양방향 설정  2. vm에 접속해서 장치 --> guest cd 이미지 삽입 그러면 왼쪽에 cd가 생길 것이다. cd클릭하기 전에 터미널에서 아래 코드 실행 sudo apt updatesudo apt upgrade 완료되면, cd 클릭하고 파일 빈 부분 우측 마우스 클릭 후 터미널 오픈 후, 아래코드 실행 sudo apt install bzip2sudo ./VBoxLinuxAdditions.run 자료출처 : https://dschloe.github.io/settings/2024/05/oracle_vm_box_ubuntu_bidirect_copy/ Oracle VM Box 양방향 복사 붙이기개요 VirtualBox를 통해 복..

1. problem : https://www.acmicpc.net/problem/10816 2. solution 1 : #include using namespace std;int n, m; vector v1; vector v2; vector ans; int lower_search_func(int& a) { int left = 0, right = n; while (left = a) right = mid; else left = mid + 1; } return left; }int upper_search_func(int& a) { int left = 0, right = n; while (left > n; for (int i = 0; i > x; v1.push_back(x); } cin >> m; f..

0. wild type과 mutant의 전사체 데이터를 비교해 보는 프로젝트를 진행하였다. 따라서, 필요한 데이터는 각 type의 전사체 데이터, annotation 파일 그리고 참조유전체 파일이다.  1. fastq 파일을 bam 파일로 바꾸자. fastq는 header 부분과 quality score 가 들어있는 파일이다. 이제 이 파일을 bam 파일로 바꿔야 된다. 그러기 위해서는 필요한 툴들부터 설치해 보자. (참고로, 이 프로젝트는 구글 코랩에서 진행하였다.) # hisat2와 samtools 설치!apt-get update!apt-get install -y hisat2 samtools위 코드를 실행하고 난 후, # 참조 유전체 경로 설정reference_path = '/content/drive..